La commune de SAINT AUBIN LE CAUF est traversée par la Béthune et bordée par la Varenne. Elle est donc adhérente aux syndicats de bassins versants de ces deux cours d'eau.

Créés il y a une dizaine d'années, ces syndicats se chargent des problèmes de ruissellement et de lutte contre les inondations, de la gestion et de l'entretien des rivières.